تتكوّن مرحلة السطوح المتوسطة من ثلاثة صفوف ، وكلّ صف يستغرق سنة دراسيّة كاملة ، ويدرس طالب العلم في هذه المرحلة الأمور التالية:


1- الفقه : دراسة مفصّلة في الفقه الاستدلالي . 

2- أصول الفقه : دراسة مبسّطة لجميع مسائل أصول الفقه . 

3- علوم اللّغة العربيّة : وتشمل دراسة مفصّلة في علم البلاغة ( المعاني , البيان , البديع ) . 

4- الفلسفة : دراسة مختصرة  معمّقة في الحكمة . 

5- العقائد : وتشمل دراسة استدلاليّة عميقة في علم الكلام . 

6- علوم القرآن : وتشمل دراسة مختصرة مفصّلة في علوم القرآن والتّفسير (قريباً).